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Biobanque et CRB : stockage des ressources biologiques en cuve d'azote
TDBiobank est un logiciel de biobanking, qui s’adresse aux CRB (centres de ressources biologiques) et biobanques, privés ou publiques (CHU, CRLCC, Cancéropôles, laboratoires, instituts de recherche, réseaux thématiques), mono ou  multisites, qui  souhaitent valoriser leurs ressources biologiques et leurs collections (tissus, produits sanguins, ADN, ARN,cellules, etc), dans le cadre des activités de recherche, de diagnostic ou de gestion des dons.
TDBioBank permet aux Centres de Ressources Biologiques (CRB) et biobanques d’assurer la traçabilité de leurs ressources et de les valoriser par des annotations clinico-biologiques pour :

  • Promouvoir la collaboration scientifique
  • Maximiser la valeur des échantillons conservés
  • Satisfaire aux exigences réglementaires, et faciliter la certification des biobanques


Ce logiciel  permet la saisie de données enrichies par des annotations clinico-biologiques, l’optimisation des emplacements de stockage, la gestion des protocoles de recherche, la constitution de collections, le suivi des cessions, l'assurance qualité et l'efficacité opérationnelle requise pour gérer un centre de ressources biologiques.

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Oui : Dans le cas d’une configuration multisite, TDBioBank apporte une réponse unique et centralisée afin de gérer efficacement la traçabilité, la sécurisation des données, et d’offrir une visibilité globale sur le stockage des échantillons,  tout en conservant l’autonomie de chaque site.

 

Témoignage client : le centre de ressources biologiques Germetheque a choisit TDBioBank pour équiper ses 5 sites... 
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La gestion fine des droits utilisateurs, permet d’attribuer un accès sélectif à l’information et aux fonctionnalités du logiciel par profil d’utilisateur, afin de garantir la confidentialité relatives à l’identité des patients, dont sont issus les échantillons.  Dans un contexte de biobanque ou  CRB (centre de ressources biologiques) multisite, il est ainsi possible de définir des groupes de sites permettant aux sites qui le souhaitent de partager, le niveau d’information requis, en fonction de leurs besoins :

  • Listes de patients
  • Listes des ressources
  • Certaines collections
  • Certains protocoles



TD
BioBank propose également un procédé permettant que l’anonymat du patient soit irréversible par un système de "hachage", tout  en garantissant la possibilité de mettre à jour toutes les données concernant le patient par un système de "chaînage". Cette fonctionnalité permet à la biobanque de s’affranchir des tables de correspondance et fait gagner un temps significatif aux utilisateurs et renforce la confidentialité des données patients.

Oui : Le module d’import de TDBioBank facilite la reprise des données de la biobanque ou du CRB, à l’occasion par exemple du basculement vers la solution TDBioBank ou lors d’une reprise de collection inter-banque. Il est ainsi possible aux biobanqueurs :

  • D’importer les données facilement et en toute autonomie
  • De s’assurer de la qualité des données liées aux ressources biologiques avant leur importation en production
Oui : L’outil de requêtes permet d'interroger la base de données de TDBioBank en créant des requêtes simples ou complexes à partir des nombreux champs contenus dans l’application (ressources biologiques, protocoles, formulaires d’annotations clinico-biologiques, etc) et d'exporter ces données.

Vous pouvez choisir d'exporter les résultats obtenus dans un fichier Microsoft® Excel® ou bien dans un fichier contenant les valeurs séparées par des séparateurs (format CSV). Le fichier généré ne nécessite pas de traitement supplémentaire et il peut être exploité immédiatement.

Les données extraites permettent notamment :

  • D’éditer des catalogues de collection étoffés et facilement exploitables,
  • De réaliser des extraction pour l’INCa
  • D’établir des statistiques
Simple et ergonomique, TDBioBank vous permet en quelques clics de valoriser les informations sur une ressource par sa composante familiale, avec la représentation graphique de l'histoire familiale d'un patient.

Il est utilisé, par exemple, pour étudier les maladies génétiques et antécédents familiaux et analyser les risques pour le patient.

Il permet également d'associer des individus présents dans l'arbre généalogique avec des patients enregistrés dans la base de données de TDBioBank, créant ainsi des liens familiaux. 

La construction de l'arbre généalogique utilise des symboles de la nomenclature internationale recommandée par la Standardized Human Pedigree Nomenclature.

Vous pouvez définir des options d'affichage en fonction de ce que vous désirez voir affiché ou non dans l'arbre généalogique.

 

TDBioBank répond aux exigences réglementaires et facilite la certification des biobanques et des centres de ressources biologiques (CRB) à la norme NFS 96-900, et l’accréditation des laboratoires à la norme ISO 15189, en offrant :

  • Une traçabilité complète des ressources biologiques et de leurs filiations
  • La sécurisation des données
  • La confidentialité des données
  • La gestion des consentements
  • La gestion des non-conformités
  • L’édition de catalogues de collections

 

TDBioBank offre bien sûr également toutes les fonctionnalités pour gérer efficacement une biobanque :

  • Saisie de données enrichies par des annotations clinico-biologiques
  • Optimisation des emplacements de stockage, Gestion des protocoles de recherche
  • Constitution de collections
  • Suivi des cessions
Oui : Le fait que le logiciel TDBioBank soit basé sur des technologies Web, qu’il utilise des standards de communication (HL7/XML) et puisse s’interfacer avec des SIH et SGL, facilite son déploiement et son intégration aux sein des organisation existantes.

  • Base de données relationnelle (Oracle®, SQL Server®), fonctionnant sur les systèmes d’exploitation UNIX®, Windows®, LINUX®
  • TDBioBank fonctionne sur un environnement  Windows® ou LINUX® avec Apache Tomcat
  • Les PC clients nécessitent Microsoft Internet Explorer et Google Chrome

 


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Communiqué de presse


Ferdinand Cabanne, l’un des plus importants CRB de France, choisit TDBioBank pour moderniser son infrastructure informatique dans le cadre de son organisation multisite. Un CRB de premier plan, certifié NF S96-900, qui dispose d’une des plus grandes salles de cryoconservation et qui héberge près de 600 000 ressources biologiques.

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